Родился 20 мая 1920 года в селе Циммермановка Хабаровского края. Супруга - Шебеко Людмила Васильевна (1921 г. рожд.). Дочери: Лилия (1946 г. рожд.), Ольга (1950 г. рожд.).

В 1940 году окончил Благовещенское художественное училище. С 1941 по 1942 год участвовал в Великой Отечественной войне. Награжден орденом Отечественной войны I степени, орденом Славы III степени, медалями.

В 1943 году поступил и в 1950 году окончил Институт живописи, скульптуры и архитектуры имени И. Е. Репина Академии художеств в Ленинграде. С 1950 по 1968 год работал преподавателем во Владивостокском художественном училище. С 1968 года по настоящее время - профессор кафедры живописи и рисунка Дальневосточного государственного института искусств.

Начиная с 1951 года принимал участие во Всесоюзных, республиканских, зональных, краевых выставках, а с 1955 года - за рубежом, в том числе в Югославии, Польше, Чехословакии, Болгарии, ГДР, Индии. Персональные выставки художника состоялись в Москве, Ленинграде (1981 г.), Саппоро (Япония, 1992 г.).

С 1951 года - член Союза художников России. Являлся членом правления Союза художников РСФСР (1960-1972 гг.), членом правления Союза художеств СССР (1972-1977 г.). В 1962-1974 годах возглавлял Приморскую организацию Союза художников РСФСР. В 1969 и 1980 годах избирался председателем зонального выставочного комитета Дальнего Востока.

Среди наиболее известных произведений: "Багульник" (1954), "Яхты" (1959), "На рыбокомбинате" (1955), "И на Тихом океане свой закончили поход" (1959), "Крабы" (1960), "Портрет Аллы Старовой" (1960), "Рыбокомбинат" (1960), "Яхты" (1960-1961), "Курильские краболовы" (1963), "На крабовую путину" (1964), "Воздушный почтальон" (1966), "Солнечный день" (1966), "Северята" (1967), "Чукчи вышли в море" (1967), "Расставание" (1967), "Труженики моря" (1967), "Богатства тундры" (1967), "Первый патруль на Чукотке" (1968), "Воздушный почтальон" (1967), "Завтрак в пути" (1969), "Осенний хоровод" (1969), "К вершинам Чукотки" (1969), "Герои Даманского" (1969), "Портрет пограничника Щуракова В. С." (1969), "Северный порт" (1969), "К вершинам Чукотки" (1970), "Первый патруль на Чукотке" (1970), "Камчатка" (1971), "Порт Анадырь" (1972), "На самой северной заставе" (1972), "Северное сияние" (1972), "Бухта Провидения" (1974), "Аэропорт в горах Камчатки" (1974), "Порт Владивосток" (1974), "Холмистые дали Чукотки" (1974), "В просторах океана" (1975), "Эстафета связи" (1975), "Таежный аэропорт" (1976), "Молодость Чукотки" (1976), "Цветет верба" (1976), "У берегов Камчатки" (1978), "В долинах Сихотэ-Алиня" (1978), "Почтовый рейс" (1978), "БАМ работает" (1980), "В тихой гавани" (1980), "У берегов Камчатки" (1982), "У Шикотана" (1982), "Порт Владивосток" (1983), "Северный аэродром" (1985), "В горах Сихотэ-Алиня" (1986), "На севере Камчатки" (1990), "Весна Камчатская" (1992), "Отдых в пути" (1993), "Бухта Провидения" (1995), "Юкольники" (1995) и другие.

Работы К. И. Шебеко находятся в Государственной Третьяковской галерее, в собраниях Дирекции выставок художественного фонда СССР и РФ, Министерства культуры СССР и РСФСР, в музеях Владивостока, Комсомольска-на-Амуре, Южно-Сахалинска, Холмска, Хабаровска, Читы, Пензы и других городов, а также в частных коллекциях в России и за рубежом.

К. И. Шебеко - Заслуженный художник РСФСР (1966 г.), Заслуженный деятель искусств РСФСР (1981 г.), член-корреспондент Российской Академии художеств (1995 г.), член-корреспондент Петровской академии наук и искусств (1999 г.), профессор. Награжден многочисленными дипломами и грамотами Министерства культуры СССР и РСФСР, Союза художников СССР и РСФСР. Его творчеству посвящены многочисленные публикации в центральной и краевой периодической печати.

Любит читать книги по искусству. Увлекается садоводством.

Живет и работает в городе Владивостоке.